? R语言在基因芯片数据处理中的应用_牛聚文档

R语言在基因芯片数据处理中的应用

R语言在基因芯片数据处理中的应用
预览:

1. R 语言安装

2. 所需要的软件包 :

2.1 affy数据处理相关的程序包

在 R 中复制 source("http://bioconductor.org/biocLite.R")

biocLite("affy")

2.2 热度图相关程序包

Gplots () :install.packages("gplots")

3. 获取基因表达数据

3.1 读取基因芯片数据(cel.files )

the.filter <- matrix(c("CEL file (*.cel)", "*.cel", "All (*.*)", "*.*"), ncol = 2, byrow = T)

cel.files <- choose.files(caption = "Select CEL files", multi = TRUE, filters = the.filter, index = 1) raw.data <- ReadAffy(filenames = cel.files)

第1页/共16页 下一页>尾页